目前凍干機都可以帶箱內壓塞裝置，小瓶凍干后，在箱內整箱壓塞，帶有缺口的特殊塞子，分裝完成后立即放在每個瓶口上，因塞子帶有缺口，并不影響升華干燥。
    凍干結束時，可以在真空狀態下壓塞，充氮壓塞，既可以減少生產環節，又能減少污染機會。
    利于進箱和出箱，對于大型凍干機而言，進箱時，把板層降下先進上層，邊進邊升；出箱時，先出下層再邊降邊出，避免使用凳子或梯子進出箱，活塞桿應該設計在箱頂上。
    利于凍干箱內的清洗，因板層可以升降，凍干箱內的各處容易接近，利于清洗。根據GMP要求，活塞桿采用不銹鋼制造，有些帶蒸汽滅菌的凍干機在活塞桿上還帶有不銹鋼波紋管的護套，確保凍干箱內達到嚴格滅菌效果。
    大型凍干機采用進口全封閉制冷機組，溫度低，捕水能力強。在使用一段時間后，必須進行清洗，若不及時清洗，又會出現哪些危害？
    蒸發器和冷阱蒙滿灰塵時，影響冷氣和熱量的散發，導致制冷或制熱效果若，費電、費時；設備開啟時，內部細菌被直接吹散到室內空氣，對人體造成直接傷害。
    若長期不清潔，吸塵網上吸附大量灰塵、螨蟲、花粉、虱子、霉菌。再次使用時，這些病菌、病毒、霉菌、灰塵就被干燥機吹送出來，引發大規模的呼吸道感染和過敏性皮炎。而頻繁更換大型凍干機，也會導致品種間的污染問題。
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